1、當前運行的在線監(jiān)測儀測量周期一般為2小時或四小時，并不能*實現(xiàn)真正意義的在線測量。如此，帶來兩方面的問題：一是由于多數(shù)企業(yè)污水COD、氨氮濃度變化比較大，排放沒規(guī)律可循，在線監(jiān)測儀所測得的數(shù)據(jù)為當時一點數(shù)值，不能反應(yīng)出真正連續(xù)排污情況;二是給了排污企業(yè)可乘之機，其在測量時刻排放達標水，在測量間隙排放高濃度廢水。

　　解決此問題的Z直接方法是增加測量頻次，但如此將會使儀器的運行費用及廢液(含汞、鉻、銀等重金屬離子)的排放量成倍增長。

　　2、隨著排污收費力度的加大，在線監(jiān)測儀的測量值將逐漸成為收費的計量依據(jù)，排污企業(yè)及管理部門對數(shù)據(jù)的準確性、有效性將更加關(guān)注。尤其當監(jiān)測數(shù)據(jù)出現(xiàn)異常時，往往會發(fā)生排污企業(yè)與運營公司或排污企業(yè)與管理部門的數(shù)據(jù)準確性糾紛，但由于事過境遷，樣品無法復現(xiàn)，很難裁決是儀器問題還是廢水問題，給收費帶來不少困難。

　　3、在線監(jiān)測儀故障維修期間，為了保證數(shù)據(jù)的連續(xù)性、有效性，往往需要用人工定時取樣的測量值作為補充。如此常常要占用大量的人力物力，尤其當排污企業(yè)較多及涉及夜間采樣時問題更為突出。

　　4、根據(jù)2009年環(huán)境保護部下發(fā)的《國家監(jiān)控企業(yè)污染源自動監(jiān)測數(shù)據(jù)有效性審核辦法》和《國家重點監(jiān)控企業(yè)污染源自動監(jiān)測設(shè)備監(jiān)督考核規(guī)程》(環(huán)發(fā)[2009]88號)的相關(guān)要求，國控污染源應(yīng)每季度進行一次比對監(jiān)測，每次比對至少采集三個樣品，由于在線監(jiān)測周期較長，現(xiàn)場樣品采集工作已成為比對監(jiān)測工作系統(tǒng)中工作量較大的環(huán)節(jié)之一，造成了人力物力的大量占用。