水環境污染、水質差是嘉興之殤，魚米之鄉的嘉興成了水質型缺水城市。造成嘉興水質差的外部原因主要是受來水影響較大，客水水質長期較差；內部原因主要是三大污染：畜禽養殖業污染、生活污水污染、工業污染。
    為有效改善水環境，嘉興積極開展“五水共治"。編制了《水環境治理綜合規劃》,分類制定了“五水共治"5個三年行動計劃，計劃到2016年，投資675.3億元，實施509個項目。今年全市開展了春季水環境綜合整治、“清三河"大會戰、拆違治污百日攻堅行動。大規模治水行動取得了階段性成果，截至今年6月初，全市已清理垃圾河1666條，整治黑河、臭河517條，占全部任務數的92.2%和74.7%；上半年交接面水質考核嘉興達到。
    嘉興市農業生產對水環境的影響
　　造成嘉興水質差的原因是多方面的，農業面源污染是水環境污染的重要因素。其中畜禽養殖業排污是污染的主因。畜禽養殖業量大且分散，大部分排泄物直排，其污染已成為zui大的農業污染源。不合理使用肥藥是面源污染的源頭，大量使用化肥農藥，經過雨水沖刷，大部分進入土壤和水體，造成水體富營養化嚴重，藻類大量繁殖，影響水質凈化與泄洪。農業廢棄物處置不當助推環境惡化，前段時間麥子收割后，麥稈焚燒現象十分嚴重，污染空氣，經水沖刷間接污染水體。嘉興市農業生產的組織化、產業化水平還不高，生產經營主體的土地使用權主要是通過短期的契約來獲得，缺少長期發展規劃，對農田水利等基礎設施建設的積極性低，導致農業灌溉與防洪排澇能力減弱。
　　農業轉型發展推進“五水共治"
　　嘉興農業轉型發展是解決農業污染、改善水環境的重要途徑，對“五水共治"有很強的推進作用。
　　嘉興畜禽養殖業通過前期拆違治污、減量提質行動，污染物排放減少近半。另外，通過綠化造林，發展綠色生態農業，凈化環境，改善水質效果明顯。提升組織化、產業化水平，有利于統一規劃，開展農田水利建設，減少洪澇災害，也有利于治水責任落到實處。改良灌溉技術，可節約用水，也可減少因漫灌造成農田養分流失、水體富營養化的現象；“肥藥雙控"，可減少水體中的養分，促進水體流動，利于防洪排澇。注重無公害、綠色有機農產品的生產，生產高品質農產品要求嚴控肥藥的使用，因而可減少對水體的污染。
　　“五水共治"與農業轉型發展互動機制
　　由于治水涉及眾多部門，要取得綜合治理效果，需成立專門的組織進行統籌管理，多部門聯合行動，農業部門既是治水責任人又是利益受益者，應積極推進農業轉型發展，參與治水行動。嘉興推行河長治水，在治水過程中取得了實效，今年3月底，已有市級“河長制"河流水質達到Ⅲ類標準，以后還須進一步研究長效的運行機制。建立治水與農業轉型相互促進，循環發展的機制，使水質改善與農業發展良性共進“五水共治"，需協調相關部門，要建立互利共贏的合作與協調機制，消除因目標不同而造成的利益沖突，明確各自的權利與義務。從改善水環境和農業發展的實際要求出發，合理設計農業轉型升級的綜合評價體系；強化績效考核，兌現獎罰，充分發揮激勵作用。
　　“五水共治"背景下嘉興農業轉型發展的對策
　　加快農業布局優化與產業結構調整。首先要合理布局畜禽業，限定區域、集群發展、控制總量。對禁養區棚舍給予分類補助限期拆除，要靠經濟手段引導轉產，讓轉產農民得到實惠。其次要發展果蔬、花卉苗木業，開展深加工，延長產業鏈，提升其附加值。再次要發展新興觀光農業，結合江南水鄉這一主題，注重系列化開發。
　　推進組織創新與經營模式轉變。發揮好農村專業合作組織的橋梁作用。通過股份制、合作制、合同制等形式，培育壯大農業企業、家庭農場，推行標準化生產，強化治水減排責任。注重無公害、綠色有機農產品的生產與認證。
　　推動生產方式與技術的改良。發展循環立體農業，推行生態種養模式，減少對外排放。種植業實行輪作生產，實施“萬元千糧"工程。推行“肥藥雙控"技術，開展測土配方農技推廣服務。推行滴灌等新型灌溉技術，利用水資源。探索農業廢棄物交換、生態綜合利用新途徑。