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1. 簡單皮實。離子阱系統（包括3D離子阱和2D線性離子阱）通常都構造相對簡單，沒有像Orbit Trap所需要的C-Trap、Z-Lens等復雜的離子傳輸電鏡；對工作環境要求不嚴苛，沒有像TOF一樣需要對環境溫度和試驗臺震動有著近乎苛刻的要求。相比較QqQ系統需要至少三套獨立射頻RF系統來飛別控制三個四極桿，一臺離子阱系統，通常只需要一組射頻RF就足夠。簡單的構造帶來的直接特點就是故障率低，皮實耐用。另一個由構造簡單帶來的特點是容易小型化，這也是為什么現在小型化質譜系統大多是基于離子阱技術的原因。2. 多極質譜。一般來說，多極質譜技術分為兩種，Tandem-in-space空間多極質譜/Tandem-in-time時間多極質譜。對于分析復雜混合樣品，多極質譜能很大程度去除背景干擾，增強信噪比，同時也能在需要解析離子結構的應用中起到很大的作用。