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　1 生化方面的分析中的應用

　　生物體內的蛋白質、肽和核酸，都以混合物狀態出現，具有強 極性，難揮發性，又具有明顯的熱不穩定性，所以用GC-MS來分析 生物大分子存在困難，需要經過深度降解，并需對降解生物作各種復雜的衍生化處理。而HPLC能分析強極性、不易揮發、高分子量及對熱不穩定的化合物；MS具有高靈敏度，能在復雜 基質中進行準確的化合物的優點，所以HPLC-MS作為生化分析的一個有力工具，正在得到日益的重視。研究人員利用HPLC-MS技術在生化方面己經有很多應用。

　　2 天然產物分析中的應用

　　利用HPLC-MS分析混合 樣品，和其他方法相比具有高效快速，靈敏度高，只需品進行簡單預處理或衍生化，尤其適用于含量少、不易分離得到或在分離過程中易的組分。因此HPLC-MS技術為天然產物研究提供了一個高效、切實可行的分析途國內利用該技術在天然產物研究中已經有很多報道。如 李麗等利用 高效液相色 質譜聯用技術研究了 朝鮮淫羊蕾中的 黃酮類化合物。