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同科生物cDNA *鏈合成試劑盒常見問題解析

來源:上海同科生物科技有限公司   2017年08月16日 13:12  

ToneScript cDNA*鏈合成試劑盒是專門用于兩步法RT-PCR的*步,含有合成高質(zhì)量*鏈cDNA所需的所有成分,適用于后續(xù)的PCR、qPCR以及基因克隆。那么在實(shí)際操作中會有哪些常見問題呢?一起來了解一下:

1、 沒有RT-PCR產(chǎn)物或產(chǎn)量低

◆RNA模板降解。RNA 的純度和完整對于反轉(zhuǎn)錄得到全長cDNA是非常重要的。提取的RNA應(yīng)進(jìn)行電泳檢測以確定其是否降解。同時RNA要避免多次反復(fù)凍融。

◆RNA模板純度低。提取RNA的過程中,可能殘留一些鹽離子、試劑,如 EDTA、酚、胍鹽、磷酸鹽、多胺等抑制接下來的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。建議用75%乙醇(DEPC 水配制)仔細(xì)清洗RNA沉淀。

◆引物不合適。選擇合適的引物,當(dāng)RNA是細(xì)菌RNA或者是沒有polyA尾的RNA要選擇隨機(jī)引物或者特異引物。

◆目的基因含有復(fù)雜二級結(jié)構(gòu)或高GC含量。建議選擇隨機(jī)引物進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。將反轉(zhuǎn)錄溫度提高至55℃。

2、RT-PCR 產(chǎn)物比預(yù)期長

◆RNA 中很可能污染了DNA。真核生物基因組DNA中含有內(nèi)含子,可能參與了 PCR擴(kuò)增,可以在反轉(zhuǎn)錄之前對RNA進(jìn)行DNaseI的消化。

3、陰性對照中有RT-PCR產(chǎn)物

◆陰性對照中有RT-PCR產(chǎn)物也表明有DNA的污染。在反轉(zhuǎn)錄之前對RNA進(jìn)行DNase I 的消化。

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