用于福爾馬林固定的石蠟包埋組織芯片需要抗原修復：
1）. 微波爐加熱：在微波爐里加熱0.01*緩沖液（pH6.0）至沸騰后將組織芯片放入，斷電，間隔5-10分鐘，反復1-2次。
適用的抗原：來源于人、大鼠、小鼠的組織標本；來源于其他動物種屬的組織標本：
Bcl-2.Bax.AR.PR.C-fos.x-jum.z-kit.c-myc.E-cadherin.
ChromograninA.Cyclin.ER.Heatshock.Protein.HPV.Ki-67.MDMZ.P53.P34.P15.P-glycoprotein.PKC.PCNA.ras.Rb.等
2）. 高壓熱修復：在沸水中加入EDTA（pH8.0）或0.01m*緩沖溶液（pH6.0）.蓋上不銹鋼鍋蓋，但不能鎖定。將玻片置于金屬染色架上，緩慢加壓，使玻片在緩沖液中浸泡五分鐘，然后將蓋子鎖定，小閥門將會升起來。10分鐘后除去熱源，置入涼水中，當小閥門沉下去后打開蓋子。此方法適用于較難檢測或核抗原的。（骨及軟骨組織的標本選擇較溫和的微波加熱修復）
3）. 沸熱修復： 電爐或水浴鍋加熱0.01M*緩沖液（pH6.0）至95℃左右，放入組織芯片加熱10-15分鐘。
4. 酶消化方法：
常用0.1%*和0.4%*液。*使用前預熱37℃，消化時間約為5-30分鐘。適用于被固定遮蔽的抗原：包括 Collagen.GFAP. Complement.Cytokeratin.c-erB-2.LCA.LN.等

福爾馬林固定的組織可能破壞了原來組織的抗原結構，蛋白多肽發生交聯，導致部分抗原表位封閉，結合位點減少，所以需要，以暴露原來的抗原表位，達到充分顯露抗原，以不出現明顯脫片現象為佳。