1.反向色譜柱實驗后的保養：

使用緩沖液或含鹽的流動相，實驗完后應用10%的甲醇/水沖洗30分鐘，洗掉色譜柱中的鹽，再用甲醇沖洗30分鐘。注意：不能用純水沖洗柱子，應該在水中加入10%的甲醇，防止將填料沖塌陷。

2.長期保存色譜柱：

如，色譜柱要長時間保存，必須存于合適的溶劑下，對于反相柱可以儲存于純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存于嚴格脫水后的純正己烷中，離子交換柱可以儲存于水(含防腐劑或硫柳汞)中，并將堵頭堵上，儲存溫度是室溫。

因為，色譜柱是消耗品，隨著使用時間或進樣次數的增加，會出現色譜峰高降低，峰寬加大或出現肩峰的現象，一般來說是柱效的下降。

1.反向柱的再生：

依次采用20～30倍的色譜柱體積的甲醇：水=10：90(V/V)，乙腈，異丙醇作為流動相沖洗色譜柱，完成后再以相反順序沖洗色譜柱。

2.正相柱的再生：

依次以20～30倍的色譜柱體積正己烷、異丙醇(異丙醇粘度大，可降低流速，避免壓力過高)、二氯甲烷、甲醇作為流動相沖洗色譜柱，然后再以相反的順序沖洗色譜柱。要注意以上溶劑必須嚴格脫水。

3.離子交換柱的再生：

長時間在緩沖溶液中使用和進樣，將導致色譜柱離子交換能力下降。用稀酸緩沖溶液沖洗可以使陽離子柱再生，反之，用稀堿緩沖溶液沖洗可以使陰離子柱再生。

特別說明：

再生過程必須隨時關注柱壓變化，柱壓過高易導致硅膠變形與開裂及鍵合相極性端連接順序紊亂，同時要保證再生時間足夠。再生時選擇不具備在線脫氣的獨立泵送系統色譜儀器進行，以防正相溶劑損壞脫氣機密封膜或分子篩及比例閥等儀器精密部件。