當您選擇毛細管色譜柱時，需要考慮一下四點基本要素：
1）固定相
2）內徑
3）柱長度
4）膜厚
①固定相
* 在滿足您的分離要求的情況下，盡可能選擇極性小的毛細柱；
* 非極性固定相主要是根據被分析物的沸點不同，來達到分離的目的；
* 隨著固定相主架上氰基、苯基數量的增加，固定相的極性增加，偶極矩或電荷分布上的差異對分離結果的影響加大（AC10/BP10、BPX35,BPX50、AC225/BP225和BPX70）；
* 對于可以產生氫鍵作用的化合物（如醛類、醇類），聚乙二醇的固定相是選擇：SolGel-WAX、AC20/BP20（WAX）和BP21（FFAP）；
* 完整的毛細管柱典型應用，請參照附錄。
②內徑
* 內徑越小則柱效越高，因此分離度越好。快速色譜柱（0.1mm內徑）被用于快速分析，因為同樣的柱效可以在更短的時間內得到。
③柱長