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通過串聯N-芳基化和硝基還原合成一種利扎霉素類似物的千克級規模中間體

時間:2023-11-21閱讀:172
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介紹

 

嗎啉環在合成化學和藥物設計中具有極其重要的地位,因為它可以出現在許多生物活性化合物中。鎮痛藥酚達諾酮和右旋莫拉胺、抗高血壓藥阿莫洛爾、抗抑郁藥莫羅西汀和瑞波西汀、抗生素禾刂奈唑胺和氟那氟氵少星以及抗癌藥物吉菲替尼都是含有嗎啉部分的FDA批準藥物。使用嗎啉本身作為親核試劑是合成這些化合物的最重要技術之一。在本研究中,我們介紹了一種大規模的兩步串聯技術,用于通過嗎啉的N-芳基化和硝基還原來合成禾刂奈唑胺類似物的關鍵中間體,該反應器系統方便地安裝在一個通風櫥內。

 

儀器風險和評估

 

反應在Phoenix II. Flow Reactor系統中進行,該系統配備了液體泵、背壓調節器,并且在還原步驟中使用H-Genie® II作為氫氣源。該設置能夠執行涉及液體或氣液混合物的高溫高壓反應,并具有較高的通量速率。Phoenix II. Flow Reactor系統能夠達到最高450℃的溫度和最高200 bars的壓力(對于液體),或者100 bars的壓力(對于氣液混合物)。反應器模塊可以配備用于均相反應的盤管,或者裝載有各種催化劑的柱。Pressure Module™負責在系統中建立背壓,使得大多數有機溶劑可以在沒有沸騰或瞬間蒸發的危險下安全過熱。液體泵能夠在高達150 bars的壓力下產生穩定的液體流量(對于10 mL/min泵為200 bars)。H-Genie® II氫氣發生器具有最大1000 NmL/min的產生能力和最大100 bars的輸出壓力。臺式氫氣生成允許化學家避免使用氫氣瓶,因為它通過水電解按需產生氫氣,無需存儲大量氣體,與傳統鋼瓶相比具有固有的安全性。

H-Genie.jpg

 

實驗程序和結果討論
嗎啉的N-芳基化初步實驗

 

將80g (0.50mol) 2,4-二氟硝基苯(1)在100mL IPA中的溶液和96g (1.1mol ,2.2eq . )嗎啉(2)在100mL IPA中的溶液混合形成兩種溶液。

 串聯圖2.png

圖1.嗎啉(2)的N-芳基化反應流反應器設置


Phoenix™ II流動反應器配備了16毫升不銹鋼環路和背壓調節器。表1總結了初步實驗中嘗試的參數組。

 

表1.N-芳基化反應步驟的優化實驗


在實驗1-6中,實驗2獲得了最佳結果,它具有最高的生產率和莞全轉化。為了微調最大吞吐量,我們進行了一項新的實驗,不使用溶劑。然而,在實驗的最初幾分鐘內,由于嗎啉氫氟化物副產物的沉淀,我們在系統中遇到了堵塞。批量實驗表明,反應混合物應至少含有50 V/V% IPA以避免這種不利事件。由于這個值接近初步實驗中使用的濃度,我們嘗試將流量增加到4.7 mL/min(停留時間:3.4 min),從而實現全轉化和6.76 mmol/min的產量。

對上述7個實驗的LC-MS分析表明,在所有嘗試的條件下,反應的區域選擇性相同。所需產物以88%的選擇性獲得,溶液中還含有5%的2- ( N -嗎啉基)區域異構體( 3a )和7%的2,4-雙( N -嗎啉基)硝基苯( 3b ) 。該溶液無需純化即可轉移到下一步合成。

 

圖2.N-芳基化步驟后的粗產物的LC-MS色譜圖


硝基還原的初步實驗


 串聯圖4.png

圖3.硝基還原的流動反應器設置


對于這組實驗,我們將Phoeni™ II. Flow Reactor連接到H-Genie® II和Pressure Module™上,如圖3所示。首先,我們嘗試將前一個實驗的溶液直接通過系統運行,但是氫氣攜帶了一些溶劑蒸氣,導致溶液更加濃縮。由于該溶液本身已經非常接近飽和,這種現象導致嗎啉氫氟化物在柱內沉淀,造成堵塞和超壓停機。為了避免這個問題,我們添加了1.23升甲醇 - 一種更好的有機銨鹽溶劑 - 將溶液濃度設定為0.35M。為了確定最佳參數和最大通量速率,按照表2所述進行了以下實驗。填充了一個1英寸寬、250毫米長的金屬密封柱,其中裝有5% Pd/C顆粒。該柱的空體積被確定為30毫升。在進行實驗之前,在室溫和15 bars的壓力下通過系統泵送甲醇和氫氣來激活催化劑床。

表2.硝基還原步驟的優化實驗


在第1-2項實驗中,觀察到了起始材料3的莞全轉化,而在20 mL/min液體流速下的實驗的轉化率開始下降。嘗試更苛刻的反應條件以提高高通量實驗的轉化率,結果在20 mL/min液體流速下轉化率達到98%。表2第5項被確定為具有最高通量和良好轉化率的最佳參數組。

還原步驟的選擇性通過LC-MS測量來確定(圖4)。在所有情況下,僅檢測到所需的胺產物(4、4a、4b),對應于在前一合成步驟中觀察到的區域異構體3、3a、3b。因此可以得出結論,硝基還原以接近定量轉化率和選擇性進行,不影響芳香環,不斷裂嗎啉部分中的C-N鍵,或檢測到任何部分還原的中間體,如N-羥基胺(在色譜圖中強度小于1%的任何3個區域異構體的峰)。

圖4.還原步驟后的粗產物的LC-MS色譜圖


多步合成4的串聯反應器系統設置

 串聯圖片6.png

圖5.多步合成4的流動反應器設置


使用前兩個實驗的結果,我們將兩個反應器系統合并為一個連續流動的串聯反應器設置,以連續進行N-芳基化和硝基還原(圖5)。在第一步中,將兩個HPLC泵連接到T型混合器,然后連接到配備有16毫升不銹鋼環路的Phoenix II. Flow Reactor。這兩個泵輸送1:1的IPA和兩種起始材料的混合物。線圈的出口連接到T型混合器,該混合器負責使用第三臺HPLC泵將溶液稀釋至0.35 M,該泵輸送甲醇。然后將該溶液轉移到類似于硝基還原步驟描述的反應器設置中:將稀釋后的混合物與來自H-Genie II的氫氣通過靜態氣液混合器合并,并進一步轉移到第二個Phoenix II. Flow Reactor中,配備有1“ MMS柱和背壓調節器。調整泵的流量,使嗎啉(1)相對于2,4-二氟硝基苯(2)具有2.2當量的過量,然后用甲醇稀釋至0.35M。

所有液體路徑的組合流量(前兩個泵組合的4.7毫升/分鐘,然后用第三臺泵以15.3毫升/分鐘稀釋)得到20毫升/分鐘的總流量,相當于理論產量為7毫摩爾/分鐘。N-芳基化步驟在100°C下進行,而對于硝基還原,反應器區域加熱至50℃。壓力模塊™設置為35 bars,這是第二步合成的最佳值。實驗連續運行了14小時(兩天內的兩個7小時時間段),每小時制備一次LC-MS樣品。該分析表明,系統保持莞全轉化12小時,之后催化劑開始失活,并且在色譜圖中開始出現少量嗎啉取代的硝基化合物(圖6)。因此,我們得出結論,為了更換或重新激活催化劑柱,反應應在12小時后停止。

 

圖6.從反應混合物中取出的12/13/14小時后的LC-MS段


收集少量產物,蒸發溶劑并通過柱色譜法(己烷:EtOAc=5:1)純化粗混合物,得到81%的所需純產物4的總收率(兩步合并)。使用理論產量7 mmol/min,可以得出結論,81%的分離產率相當于5.67 mmol/min的實際產物產量。由于催化劑柱需要在12小時后更換或激活,我們計算了一整天三個8小時班次能夠生產產物22小時,相當于約7.5摩爾或約1.47千克/天的產物產量。

 

總結和結論

 

通過使用方便地安裝在標準通風櫥中的串聯連續流動反應器設置,證明了一種有效和安全的兩步驟合成方法,用于制備Linezolid類似物關鍵中間體4。這兩個步驟的反應都具有定量轉化率和高選擇性,導致所需產物的81%分離產率和1.47 kg/天的產量。

串聯圖片8.png 

圖7. 總結反應方案和結果

參考文獻

1. A. P. Kourounakis, D. Xanthopoulos, A. Tzara: Morpholine as a privileged structure: A review on the medicinal chemistryand pharmacological activity of morpholine containing bioactive molecules, Med. Res. Rev., 40(2), 2020, 709-752.

2. For earlier results on small scale synthesis, see: R. Örkényi, J. Éles, F. Faigl, P. Vince, A. Prechl, Z. Szakács, J. Kóti, I. Greiner: Continuous Synthesis and Purification by Coupling a Multistep Flow Reaction with Centrifugal Partition Chromatography, Angew. Chem., 129, 2017, 8868-88.

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