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進行PCR操作時，操作人員應該嚴格遵守一些操作規程，最da程度地降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現。
劃分操作區：目前，普通PCR尚不能做到單人單管，實現wan全閉管操作，但無論是否能夠達到單人單管，均要求實驗操作在三個不同的區域內進行，PCR的前處理和后處理要在不同的隔離區內進行：
(1)標本處理區，包括擴增摸板的制備。
(2)擴增區，包括反應液的配制和PCR擴增。
(3)產物分析區，凝膠電泳分析，產物拍照及重組克隆的制備。
(4)各工作區要有一定的隔離，操作器材專用，要有一定的方向性。如：標本制備→PCR擴增→產物分析→產物處理。
切記：產物分析區的產物及器材不要拿到其他兩個工作區。
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